多取皮脂腺囊肿、皮样或表皮样囊肿停行分辩。脂肪瘤是皮下局限性肿块，球形或分叶状，量软，取皮肤无粘连，可敦促。正常展开迟缓。

2、神经纤维瘤

多于皮样或表皮样囊肿停行分辩。该病为自幼发作，暗示为皇豆至核桃大半球形、空泡样疝状物，量软。神经纤维瘤常为多发，可分布身体任何部位，并伴随多个皮肤咖啡斑（常多于6个）。用指尖可压入瘤内，压力去除后可还本。

3、异位甲状腺

多于甲状舌管囊肿停行分辩。二者均为甲状腺先天异样，正在胚胎发育上密切相关。异位甲状腺常位于舌根部或舌盲孔的咽部，呈瘤状突起，外表紫蓝涩，量地柔软，边界清楚，患者常有语言不清，重大者可显现吞咽、呼吸艰难。由于75%的异位甲状腺为独一有罪能甲状腺组织，舛错将其切除将招致毕生甲状腺罪能低下的重大成果。临床上要留心两者的分辩，喷射性核素扫描是最有效的分辩办法，异位甲状腺部位可见核素浓聚或颈部未及甲状腺组织便可作出诊断。

4、其余

如颌骨囊肿应取地方性血管瘤、炎性肉芽肿、恶性病变等加以分辩，但凡通过X线片、活检等明白诊断；鳃裂囊肿位置较深者应留心和神经鞘瘤、颈动脉体瘤等区别，穿刺病理学检查有利于分辩。